Análisis genómico del locus MAT en Mycosphaerella fijiensis / (Record no. 5469)

MARC details
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001 - CONTROL NUMBER
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003 - CONTROL NUMBER IDENTIFIER
control field MX-MdCICY
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fixed length control field 180907s2007----mx-a---f#m---#000-0#spa-#
040 ## - CATALOGING SOURCE
Transcribing agency CICY
090 ## - LOCALLY ASSIGNED LC-TYPE CALL NUMBER (OCLC); LOCAL CALL NUMBER (RLIN)
Classification number (OCLC) (R) ; Classification number, CALL (RLIN) (NR) TD
Local cutter number (OCLC) ; Book number/undivided call number, CALL (RLIN) C653 2007
100 1# - MAIN ENTRY--PERSONAL NAME
Personal name Conde Ferráez, Laura
245 10 - TITLE STATEMENT
Title Análisis genómico del locus MAT en Mycosphaerella fijiensis /
Statement of responsibility, etc. Laura Conde Ferráez
264 31 - PRODUCTION, PUBLICATION, DISTRIBUTION, MANUFACTURE, AND COPYRIGHT NOTICE
Place of production, publication, distribution, manufacture Mérida, Yuc.,
Date of production, publication, distribution, manufacture, or copyright notice 2007
300 ## - PHYSICAL DESCRIPTION
Extent xiv, 96 h. :
Other physical details il. ;
Dimensions 24 cm.
502 ## - DISSERTATION NOTE
Dissertation note Tesis (Doctorado en Ciencias y Biotecnología de Plantas) .-- Centro de Investigación Científica de Yucatán, 2007.
520 3# - SUMMARY, ETC.
Summary, etc. Mycosphaerella fijiensis, agente causal de la Sigatoka negra, la enfermedad más devastadora del banano y plátano, es un ascomiceto heterotálico, con un tipo de apareamiento bipolar. En hongos con este tipo de reproducción, los genes mat representan una herramienta poderosa para identificar líneas compatibles sexualmente ya que determinan el tipo de apareamiento de las diferentes líneas. Los genes responsables de la especificidad y desarrollo sexuales se localizan en locus MAT. En este locus se encuentran una de dos formas alternativas denominables idiomorfos mat1-1 y mat 1-2, que son llamados así por poseer secuencias totalmente diferentes entre si. Además, se han utilizado en análisis poblacionales y como marcadores genéticos, en comparación con las secuencias de los ITS. Los genes MAT representan un relativamente bajo porcentaje de conservación en secuencia de nucleotidos entre los ascomicetes (alrededor de un 24-64 por ciento de identidad). Sin embargo, las regiones características de la caja alfa y HMG (en mat1-1 y mat 1-2 respectivamente) presentan mayor porcentaje de identidad entre especies distantes. En el presente trabajo se realizaron experimentos para ubicar físicamente el locus MAR dentro del cariotipo molecular de M. fijiensis, por medio de Southern blot y sondas reactivas. Al mismo tiempo, se intentó ubicar el locus dentro de una biblioteca genómica tipo BAC. Usando oligonucleótidos degenerados, se logró amplificar la caja HMG de mat1-2 de M- fijiensis, la cual mostró homología con la de Mycosphaerella graminicola. Se clonaron y secuenciaron los genes de la DNa liasa y sla2, los cuales se encuentran flanqueando a este locus en varias especies de levaduras y hongos filamentosos, usando oligos degenerados. Mediante la estrategia de "DNA walking", anclándose en la DNA liasa hacia la caja HMG, se obtuvo la región de mat1-2 de 9 kb. Usando PCR de amplio rango con oligos en las regiones flanqueantes, las cuales tienen cerca de 100 por ciento de identidad entre los idiomorfos, se obtuvo un amplicón de 5kb correspondiente a mat 1-1. Se encontraron regiones invertidas con altos porcentajes de identidad (77-89 por ciento) dentro de los idiomorfos de M. fijiensis, lo que sugiere eventos únicos de inversión que nunca han sido publicados y que podrían haber sido significativos en la evolución de esta especie. Los genes predichos presentan los intrones conservados en ambos idiomorfos y además un intrón adicional dentro de la caja alfa. Se discuten las impliaciones en la evolución de las especies del complejo Mycosphaerella en el banano.
650 14 - SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM
Topical term or geographic name entry element GENOMA VEGETAL
650 14 - SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM
Topical term or geographic name entry element MYCOSPHAERELLA FIJIENSIS
General subdivision ENFERMEDADES Y PLAGAS
650 14 - SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM
Topical term or geographic name entry element PATOLOGIA VEGETAL
650 14 - SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM
Topical term or geographic name entry element PLATANO
General subdivision ENFERMEDADES Y PLAGAS
650 14 - SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM
Topical term or geographic name entry element SIGATOKA NEGRA
General subdivision ENFERMEDADES Y PLAGAS
700 12 - ADDED ENTRY--PERSONAL NAME
Personal name James Kay, Andrew,
Titles and other words associated with a name Dr.,
Relator term Asesor de tesis
856 40 - ELECTRONIC LOCATION AND ACCESS
Uniform Resource Identifier <a href="http://cicy.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1003/1110">http://cicy.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1003/1110</a>
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942 ## - ADDED ENTRY ELEMENTS (KOHA)
Source of classification or shelving scheme Clasificación local
Koha item type Tesis
Holdings
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  Clasificación local     Tesis CICY CICY Sección de tesis 09.10.2024   TD C653 2007 T0668 09.10.2024 09.10.2024 Tesis