Base de Datos : identificación de factores de transcripción tipo CpWRKY, CpHSF, CpMYB, CpbHLH y CpbZIP en Carica papaya / Erick Arroyo, Yessica Bautista, Amaranta Girón, Arianna Chan, Humberto Estrella, Gabriela Fuentes, Jorge M. Santamaria

El disco compacto se encuentra en la oficina de procesos técnicos.

La expresión reguladora de los genes es fundamental para la mayoría de los procesos biológicos, como el desarrollo, la diferenciación y la respuesta a las señales ambientales. La regulación transcripcional está mediada en gran medida a través de proteínas de unión a ADN, conocidas como Factores de Transcripción (TF), que reconocen elementos ubicados en las regiones promotoras de los genes. Se desarrolló una metodología para la identificación de 5 familias de TF a partir de la reciente re-secuenciación del genoma de Carica papaya cv SunUp, mediante la búsqueda de homologías con las secuencias WRKY, MYB, bHLH, bZIP y HSF de Arabidopsis thaliana, para la construcción de una base de datos. Se identificaron y anotaron un total de 48 factores de transcripción CpWRKY, 94 CpMYB, 82 CpbHLH, 47 CpbZIP y 19 CpHSF. Para cada uno de ellos se describió el ID asignado, el inicio y fin de la transcripción del gen, la ubicación y la posición cromosómica correspondiente. Esta información proporciona una herramienta valiosa para identificar genes y proteínas poco estudiados para el análisis funcional, e inferir los mecanismos de regulación que ocurren en la célula en respuesta a cambios ambientales, para futuros proyectos de mejoramiento genético en el cultivo tropical Carica papaya.