Identificación, caracterización y relaciones filogenéticas de los begomovirus detectados en plantas nativas y cultivadas de la Península de Yucatán / Cecilia Hernández Zepeda

Tesis (Doctorado en Ciencias y Biotecnología de Plantas) .-- Centro de Investigación Científica de Yucatán, 2007.

Los geminivirus transmitidos por mosquita blanca Bemisia tabaci (Genn), pertenecen al género Begomovirus. Los miembros de este género son capaces de infectar plantas dicotiledóneas, las cuales taxonómicamente se encuentran en el clado de las Eudicotiledóneas. Las epidemias asociadas a los begomovirus, han causado considerables pérdidas en diferentes cultivos de importancia económica en regiones tropicales y subtropicales del mundo. En el presente trabajo, se detectó la presencia de begomovirus en plantas nativas y especies cultivadas con síntomas característicos de infección por virus, colectadas en diferentes localidades de la Península de Yucatán. Se utilizaron cebadores universales para amplificar un fragmento del gen de la proteína de la cápside (core Cp) (-576 pares de bases) de los begomovirus. Los fragmentos amplificados fueron clonados y secuenciados con el fin de obtener la identificación preliminar de los begomovirus detectados. A partir de las plantas positivas, se realizó la amplificación, clonación y secuenciación del gen de la proteína de la cápside (Cp) (-756 pares de bases). Los resultados indicaron la presencia de 13 especies de begomovirus, infectando plantas nativas y cultivadas pertenecientes a siete familias diferentes. Entre las 13 especies de begomovirus, se detectaron cinco especies no descritas previamente, las cuales fueron llamadas de manera provisional como Anoda golden mosaic virus (AnGMV), Boerhavia yellow spot virus (BoYSV), Papaya golden mosaic virus (PaGMV), Desmodium leaf distortion virus (DeLDV), e Hibiscus variegation virus (HiW). Se detectaron por primera vez en la Península de Yucatán, cinco begomovirus descritos previamente en otras regiones, los cuales fueron el Euphorbia mosaic virus (EuMV), el Me/on chlorotic leaf curl virus (MCLCuV), el Okra yellow mosaic Mexico virus (OkYMMV), el Sida golden mosaic virus (SiGMV), y el Tobacco apical stunt virus (TbASV). También se detectaron tres begomovirus ya reportados previamente en la Península de Yucatán, el Bean golden yellow mosaic virus (BGYMV), el Pepper golde n mosaic virus (PepGMV) y el Tomato mottle virus (ToMoV) en hospederos cultivados. Se diseñaron cebadores universales y específicos a partir de las secuencias obtenidas del core Cp para amplificar parcial o totalmente los genomas utilizaron cebadores universales para amplificar la región común (-1.3 kilo I de los begomovirus aislados. Con base en estas secuencias obtenidé diseñaron cebadores específicos para cada especie viral. Los fragmentos( genoma A y del genoma B fueron clonados y secuenciados, posteriormente editaron las secuencias para obtener la secuencia completa del genoma fJ secuencias completas/parciales del genoma B de cinco begomovirus aislado plantas nativas de la Península de Yucatán. El análisis de las secuencia genoma A reveló la presencia de las características típicas de los miembros género Begomovirus. Se confirmó la presencia de cinco nuevos begomovirusreportados previamente los cuales fueron el BoYSV, el Corchorus yellow Yucatán virus (CoYVYuV), el DeLDV, el HiW y el Sida yellow mosaic virus (SiYMYuV). Dentro de las especies virales detectadas, el virus asociado a plan Euphorbia heterophylla L. fue la especie con una mayor distribución entre lo de colecta. El begomovirus aislado de estas plantas fue identificado Euphorbia mosaic virus-Yucatan Peninsula (EuMV-YP), el cual es un aislal EuMV que fue detectado por primera vez en Puerto Rico. Para caracterizar rango de hospederos experimental de este virus, se utilizó el ADN de infectadas de E. heterophylfa, con el fin de realizar la construcción de infectivas en forma de monómeros. Mediante la técnica de biobalístic introdujeron los monómeros del genoma A y B del EuMV- YP en planta algodón, calabaza, chile, Datura stramonium, E. heterophylfa, fríjol, parvifora y tomate. Los síntomas obtenidos de manera experimental similares a los síntomas observados en campo en las plantas de E. hetero los cuales consistieron principalmente en mosaicos dorados. La evi obtenida indicó que el EuMV- YP es el agente causal de la enfermedad de mi dorado observada en las plantas de E. heterophylfa de la Península de Yuc que este virus es capaz de infectar de manera experimental cinco es representativas de las familias Solanaceae, Fabaceae y Euphorbiaceae.