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Construcción de un mapa genético de ligamiento del hongo patógeno del banano Mycosphaerella fijiensis usando marcadores moleculares / Gilberto Manzo Sánchez

Por: Tipo de material: TextoTextoEditor: Mérida, Yuc., 2007Descripción: xi, 115 p. : il. ; 24 cmTrabajos contenidos:
  • James Kay, Andrew, Dr [Asesor de tesis]
Tema(s): Recursos en línea: Nota de disertación: Tesis (Doctorado en Ciencias y Biotecnología de Plantas) .-- Centro de Investigación Científica de Yucatán, 2007. Resumen: El hongo Mycosphaerella fijiensis Morelet causante de la Sigatoka negra, es la enfermedad del follaje más destructiva de bananos y plátanos. Se encuentra ampliamente distribuido en casi todas las regiones productoras del mundo, llega a provocar grandes pérdidas económicas cuando no se tiene un método de control adecuado. Por lo tanto, surge la necesidad de implementar nuevas tecnologías moleculares para un mejor entendimiento y manejo del patógeno. Con este fin se han desarrollado mapas genéticos en algunos hongos fitopatógenos, además mediante el apoyo de los marcadores je ADN se ha podido identificar y etiquetar los genes deseables, como por ejemplo genes de avirulencia. En este estudio se realizaron cruzas en condiciones in vitro entre aislados procedentes de varios países y diferentes cultivares. La cruza entre el aislado CIRAD86 (de Camerún, mating type +) y CIRAD139A (de Colombia, mating type -) fue usada para construir un mapa genético de ligamiento. Se analizó una progenie formada por 61 individuos mediante marcadores moleculares, siendo 298 marcadores AFLP y ´5 marcadores SSR los que integraron el mapa genético de ligamiento. El mapa fue generado usando el software JoinMap 3.0 con un valor mínimo de LOD mayor o menor 3.0. Se obtuvieron veintitrés grupos de ligamiento, conteniendo 5 o más marcadores estos cubrieron una longitud de 1879 cM. El locus mating type no pudo ser mapeado. La Densidad promedio entre marcadores fue de 5.9 cM (un rango de 1 a 21 cM). El tamaño físico en relación a la distancia genética fue de aproximadamente 40.9 kpb/cM. El tamaño del genoma estimado para M. fijiensis fue calculado para ser 4303.5 cM. El mapa genético De ligamiento aquí reportado es el primero en este importante patógeno de bananos y plátanos, el cual podría ser de gran utilidad Dará usos en estudios de evolución con otros hongos y como anclaje para ensamblar la secuencia del genoma de M. fijiensis.
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Tesis Tesis CICY Sección de tesis Tesis TD M35 2007 (Browse shelf(Opens below)) Available T0669

Tesis (Doctorado en Ciencias y Biotecnología de Plantas) .-- Centro de Investigación Científica de Yucatán, 2007.

El hongo Mycosphaerella fijiensis Morelet causante de la Sigatoka negra, es la enfermedad del follaje más destructiva de bananos y plátanos. Se encuentra ampliamente distribuido en casi todas las regiones productoras del mundo, llega a provocar grandes pérdidas económicas cuando no se tiene un método de control adecuado. Por lo tanto, surge la necesidad de implementar nuevas tecnologías moleculares para un mejor entendimiento y manejo del patógeno. Con este fin se han desarrollado mapas genéticos en algunos hongos fitopatógenos, además mediante el apoyo de los marcadores je ADN se ha podido identificar y etiquetar los genes deseables, como por ejemplo genes de avirulencia. En este estudio se realizaron cruzas en condiciones in vitro entre aislados procedentes de varios países y diferentes cultivares. La cruza entre el aislado CIRAD86 (de Camerún, mating type +) y CIRAD139A (de Colombia, mating type -) fue usada para construir un mapa genético de ligamiento. Se analizó una progenie formada por 61 individuos mediante marcadores moleculares, siendo 298 marcadores AFLP y ´5 marcadores SSR los que integraron el mapa genético de ligamiento. El mapa fue generado usando el software JoinMap 3.0 con un valor mínimo de LOD mayor o menor 3.0. Se obtuvieron veintitrés grupos de ligamiento, conteniendo 5 o más marcadores estos cubrieron una longitud de 1879 cM. El locus mating type no pudo ser mapeado. La Densidad promedio entre marcadores fue de 5.9 cM (un rango de 1 a 21 cM). El tamaño físico en relación a la distancia genética fue de aproximadamente 40.9 kpb/cM. El tamaño del genoma estimado para M. fijiensis fue calculado para ser 4303.5 cM. El mapa genético De ligamiento aquí reportado es el primero en este importante patógeno de bananos y plátanos, el cual podría ser de gran utilidad Dará usos en estudios de evolución con otros hongos y como anclaje para ensamblar la secuencia del genoma de M. fijiensis.

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