Filogenia molecular en Capsicum / Josefina Inés Maldonado Borges

Tesis (Maestría en Ciencias y Biotecnología de Plantas) .-- Centro de Investigación Científica de Yucatán, 2007.

El género Capsícum L. (Solanaceae) ha sido fuente de confusión taxonómica desde hace siglos; esto debido a problemas en la delimitación del género y las especies, en la nomenclatura de formas silvestres y domesticadas y en el tratamiento de la variación infraespecífica. El objetivo de este trabajo fue corroborar si Capsícum constituye un grupo monofilético, así como inferir las relaciones filogenéticas dentro del género. Para resolver estas preguntas se analizaron las secuencias de los genes ribosomales nucleares 5S y 5.8S, y sus correspondientes espaciadores no-transcitos y transcritos, NTS e ITS, ampliamente utilizados para resolver relaciones por abajo del nivel de género. Con el análisis de contenido de bases de guanina y citosina (GC), y de patrones de sustitución de nucleótidos se identificó la variabilidad intragenómica en las secuencias de los genes 5S y 5.8S del ADNr de cinco especies de Capsícum; conjuntamente el plegamiento de estructuras secundarias de los genes 5S y 5.8S, así como motivos claves para el procesamiento de genes ribosomales en ITS1 e ITS2, sirvió para diferenciar genes funcionales de pseudogenes. La información de secuencias funcionales de los espaciadores (NTS e ITS) de ambos genes ribosomales permitió identificar las relaciones entre algunas especies del género. Sin embargo, las inconsistencias observadas entre ciertas accesiones, respecto de su ubicación en la topología de los árboles y su identidad fenotípica, sugiere que se debe revalorar su caracterización morfológica y, en su caso, realizar pruebas citogenéticas para esclarecer si se trata de híbridos.