Identificación de familias de retrotransposones LTR en tres especies de agave / José Javier Huijara Vasconselos

Tesis (Maestría en Ciencias Biológicas : Opción Biotecnología) .-- Centro de Investigación Científica de Yucatán, 2010.

Existen dos tipos de elementos móviles los transposones (tipo 11) y retrotransposones (tipo 1) que difieren en su mecanismo de transposición. Los primeros cambian de un lugar a otro a través de un mecanismo de corta y pega, mientras que los retrotransposones lo hacen a través de un intermediario de ARN. Se ha demostrado que los retrotransposones están ampliamente distribuidos en el genoma de las plantas y en diversas especies representan una porción considerable de su genoma además de participar en diversos mecanismos relacionados con evolución. Por otro lado, el género Agave ha acompañado al hombre americano por varios siglos, y sus especies son utilizadas como plantas ornamentales y para la producción de fibra, esteroides, pulque, tequila, por mencionar algunos usos. De acuerdo a las características florales, las especies de Agave se clasifican en dos subgéneros: Littae y Agave. Mencionado lo anterior como marco conceptual, el objetivo de este trabajo fue identificar y caracterizar diferentes familias de retrotransposones Ty1-copia y Gypsy en tres especies de Agave (A. tequilana, A. fourcroydes yA. angustifolia). Para identificar las diferentes familias, se aislaron fragmentos de retrotransposones, por PCR con cebadores degenerados que reconocen un domino de la región transcriptasa reversa de los retrotransposones Ty1-copia y Gypsy presente en éstos. Se realizaron alineamientos múltiples y se encontró que los retrotranposones Gypsy son más heterogéneos que los Ty1-copia con un 11 por ciento y 22 por ciento de identidad respectivamente. Con base en el agrupamiento de las secuencias, en este trabajo, se logro identificar 6 familias de retrotransposones Ty1-copia y 2 de Gypsy. Su posible implicación en evolución de poliploides de Agave es discutida.