Desarrollo de marcadores SCAR a partir de AFLP en Agave tequilana / Nelly Beatriz Sansores Santos

Tesis (Maestría en Ciencias Biológicas : Opción Biotecnología) .-- Centro de Investigación Científica de Yucatán, 2012.

La caracterización de una secuencia específica a algún determinado genotipo la cual es identificada en un perfil de AFLP (polimorfismo en la longitud de los fragmentos amplificados, por sus siglas en inglés) ó que se presenta únicamente en alguna especie ó variedad vegetal, se considera como un marcador potencial que puede ser utilizado en identificación vegetal. A este respecto, el caracterizar y convertir una secuencia AFLP en un marcador de secuencia específica SCAR (Amplificación de Regiones de Secuencia Caracterizada, por sus siglas en inglés) permite desarrollar una estrategia para la evaluación de cada loci polimórfico AFLP de manera individual en el genoma de cada variedad. En el presente trabajo se analizó el potencial de formación de SCAR a partir de 6 bandas de AFLP específicas provenientes de 4 variedades (Azul, Sigüin, Moraleño y Chato) de la especie Agave tequilana Weber. Nuestros resultados permiten proponer 2 fragmentos encontrados: el G5140-Mñ251 y el G299-Sg240, como marcadores SCARs para el desarrollo de marcadores moleculares en identificación vegetal para tales variedades de Agave. A partir de nuestros resultados, es posible discutir que el empleo de la técnica de AFLP como método de análisis genómico diferencial en su mayoría se limita únicamente a la detección de mutaciones en los sitios de restricción reconocibles por las endonucleasas (EcoRI y Msel, en el presente trabajo) en el genoma entre las especies y variedades ensayadas. No se encontraron secuencias internas propias a alguna variedad en los fragmentos AFLP polimórficos evaluados. De aquí el bajo porcentaje obtenido de SCARs generados a partir de bandas AFLP con polimorfismo a nivel de variedad. Fueron utilizados geles de poliacrilamida preparados desde el 2005 para la recuperación de sus fragmentos AFLP.