Diversidad genética y filogenia de las tres principales divisiones de microalgas dulceacuícolas en dos cenotes de Quintana Roo, México / Fayco Sayd Amateco Rivero

Tesis (Maestría en Ciencias del Agua) .-- Centro de Investigación Científica de Yucatán, 2015.

Los cenotes son sitios que poseen una amplia diversidad de microorganismos entre los cuales se incluyen a las microalgas. Las microalgas son un grupo de organismos microscópicos que se caracterizan por ser principalmente acuáticos, fotosintéticos y por ser la base de la cadena trófica en los cuerpos de agua. En el presente trabajo se analizó la diversidad genética de las tres Divisiones más importantes de microalgas (Cianobacteria, Bacillariophyta y Chlorophyta) presentes en cuerpos dulceacuícolas, utilizando la secuenciación de fragmentos de los genes ribosomales 18S y 23S. Las muestras fueron colectadas durante Febrero del 2014 en dos cenotes localizados en el noreste del estado de Q. Roo. En cada sitio se tomaron los parámetros físico-químicos in situ y se cuantificaron los nutrientes en el laboratorio. Las muestras de agua fueron tomadas de la superficie y filtradas (0.45 J.Lm); el material biológico colectado en los filtros fue utilizado para extraer ADN total. Se realizó la amplificación por PCR, utilizando cebadores específicos para cada una de las tres Divisiones; los fragmentos obtenidos (410-516 pb dependiendo de los cebadores utilizados) fueron clonados y secuenciados. Las secuencias (182) fueron comparadas en BLAST, además se alinearon utilizando MUSCLE (MEGA 6.0) para determinar los porcentajes de identidad de los nucleótidos. Los OTU´s (Unidades Operacionales Taxonómicas) fueron identificados utilizando un corte del 97 por ciento de identidad de nucelótidos. Se elaboraron listados con el número de clonas separadas por OTU´s para los dos sitios. Los resultados indicaron que la menor diversidad de OTU´s (considerando las tres Divisiones) se encontró en el cenote eutrófico de Playa del Carmen con un total de 12 OTU·s. El cenote de Leona Vicario fue el más diverso con un total de 31 OTU·s. Las tres Divisiones de microalgas se encontraron en ambos sitios, sin embargo, al utilizar el corte del 99 por ciento se identificaron algunas especies, las cuales fueron diferentes en c~da sitio, lo que indica que la comunidad de microalgas difiere entre cenotes. De las 182 clonas estudiadas el 17 por ciento perteneció a Chlamydomonas applanata y el 13 por ciento a Frustulia cassieae, haciendo de éstas las más abundantes para Playa del Carmen y Leona Vicario respectivamente. Se registraron por primera vez en el estado de Quintana Roo las especies Nitzschia supralitorea, N. palea, N. bizertensis, Navicula gregaria, Frustulia cassiae, Chlamydomonas applanata, C. Mexicana, C. noctigama, Botryococcus terribilis, B. braunii, Tetracystis pulchra, T. sarcinalis, Asterococcus korschikoffii y Spongiochloris spongiosa.