Análisis metagenómico de comunidades bacterianas de suelos contaminados con detergentes /
Alejandra Socorro Ramos Castillo
- x, 76 p. : il. ; 28 cm.
Tesis (Maestría en Ciencias Biológicas : Opción Biotecnología) .-- Centro de Investigación Científica de Yucatán, 2013.
Los suelos poseen una inmensa diversidad bacteriana que ha sido muy poco explorada debido principalmente al carácter no cultivable de la gran mayoría de los microorganismos. La metagenómica se caracteriza por permitir el estudio masivo del conjunto de genomas (metagenoma) de las comunidades microbianas, sin la necesidad de realizar cultivos previos, permitiendo el análisis del material genético de conjuntos de microorganismos cultivables y no cultivables contenidos en una muestra ambiental. Los detergentes descargados al ambiente constituyen un contaminante que puede ser degradado o utilizado como fuente de nutrientes por algunos microorganismos o un inhibidor de las poblaciones para las cuales resulten nocivos, por lo que es de suponer que modifican la estructura de las comunidades bacterianas. El presente trabajo analizó, mediante técnicas metagenómicas, el impacto que los detergentes han ejercido sobre la composición y diversidad de las comunidades bacterianas en muestras de suelo recolectadas en el municipio de Hunucmá, Yucatán, México. Se determinó y analizó la diversidad relativa bacteriana de suelos expuestos y no expuestos a detergentes se analizó de dos maneras, mediante el análisis estadístico de los datos obtenidos de la electroforesis en gel con gradiente desnaturalizante (DGGE) de los productos amplificados de la región V3 del gen 16 ribosomal bacteriano, y mediante el análisis de las lecturas obtenidas a partir de la secuenciación del gen 16S ribosomal. En ambos casos fueron aplicados índices ecológicos, lo que permitió realizar comparaciones entre las comunidades bacterianas de los diferentes suelos. Se realizaron análisis edáficos para determinar los principales cambios en los factores fisicoquímícos de los suelos que han sufrido contaminación con detergentes. Se identificaron los taxa dominantes a diferentes distancias genéticas. Proteobacteria. Acidobacteria, Actinobacteria, Bacteroidetes, Verrucomicrobia, Firmicutes y Chloroflexi fueron los phyla dominantes en los ambientes edáficos. Las especies más representativas en los suelos contaminados fueron Rhodomicrobium sp., e Hydrogenophaga sp. Los parámetros fisicoquímícos y las abundancias relativas bacterianas de los suelos analizados fueron correlacionados mediante un análisis de componentes principales, el cual determinó que el sodio y la salinidad son los factores que más influyen en las abundancias relativas bacterianas de los suelos analizados. El presente estudio representa el primer reporte a nivel local en donde se analiza la diversidad bacteriana en suelos contaminados con detergentes.
CONTAMINACION DE SUELOS--DETERGENTES--YUCATAN (MEXICO)