Single nucleotide polymorphisms (SNPs) in partial sequences of three musa genes involved in starch metabolism / Muhilan Mahendhiran

Tesis (Doctorado en Ciencias Biológicas : Opción Biotecnología) .-- Centro de Investigación Científica de Yucatán, 2014.

El almidón es la fuente de energía más importante en la dieta del humano y en la ruta metabólica del anabolismo y catabolismo de las plantas superiores, así como bananos y plátanos, está bajo un estricto control de regulación. El presente estudio está dirigido a encontrar Polimorfismos de un Solo Nucleótido (del inglés SNPs) basados en PCR en secuencias parciales de genes clave en el metabolismo del almidón en 10 accesiones de Musa. Estos incluyen representantes de ancestros silvestres (AA y BB), de consumo en fresco o postres (AA, AAA Y AAB), plátanos (genoma AAB), bananas de cocción (ABB), y bananos para cerveza (AAA). Para lograr entender las bases de esas diferencias a nivel molecular, tres genes candidatos, que representan pasos claves en el metabolismo del almidón, se seleccionaron para su análisis de secuenciación y bioinformáticos. Estos fueron: ADP-glucosa pirofosforilasa (AGPasa) , sacarosa sintetasa (SUCS) y almidón sintetasa (SS). Los análisis bioinformáticos mostraron que SNPsI Indels estuvieron presentes en regiones codificantes y no codificantes de los fragmentos de genes. Secuencias parciales de la sub-unidad grande (LSU) de la AGPasa mostraron que existen cuatro variantes en las accesiones de Musa, debido a los SNPsllndels presentes en los fragmentos de genes de las diez accesiones. En SUCS fueron encontradas 2 variantes (pueden ser isoformas) y para SS dos variantes (posiblemente alelos) en el mismo cromosoma fueron identificados a partir del análisis de secuencias. De estos resultados podemos concluir que el pOlimorfismo de la familia de genes de AGPasa. SUCS y SS ocurre incluso en la pequeña colección representativa del cultivar de Musa y especies silvestres.